Редакция сообщила, что отныне «Моряк» будет выходить в форме журнала. Действительно, тринадцатый и четырнадцатый номера изданы журнальным форматом и объемом. Теперь они печатались в парижской типографии РСДРП. В выходных данных есть французская марка типографии и адрес по-русски: Париж, бульвар Сен-Жак, 46, кооперативная типография «Союз», Номер четырнадцатый сообщал о создании французской группы «Союза черноморских моряков», давал ее парижский адрес: улица Гобеленов, 63, а также новые адреса в иностранных портах для отправки материалов в газету. С 14 по 21 февраля 1913 года в Александрии проходила I Всероссийская конференция морских профессиональных организаций судовых команд, на которой редколлегия «Моряка» выступила с отчетом.

Но агенты царской охранки шли по следам «Моряка». Весной 1913 года в Константинополе арестован член редколлегии Петр Бастричев, в мае в Александрии — Михаил Адамович и еще один член редколлегии Владимир Мирский-Ма-риниоло. По доносу провокаторов их арестовала британская колониальная полиция — якобы за печатание фальшивых английских денег. Она конфисковала все имущество редакции, ее архивы и ценные бумаги, а потом передала российским жандармам. Арестованных членов редколлегии «Моряка» доставили в Одессу на рейсовом пароходе «Император Николай II» в сопровождении... двух миноносцев!

В портах Черного моря и на судах прокатилась новая волна арестов. Затем состоялся судебный процесс, как писали «Одесские новости», «по делу 76 матросов Черноморского Коммерческого флота, обвиняемых в организации противоправительственного сообщества». «Центральной фигурой процесса,— сообщала газета,— является бывший редактор журнала «Моряк» М. П. Адамович».
Четырнадцатый номер смог выйти лишь спустя несколько месяцев после предыдущего — 12 сентября 1913 года. К нему был приложен листок-предостережение, в котором шла речь об агентах охранки, проникших в Загранцентр «Союза», назывались имена провокаторов. Подробности об их «деятельности» газета обещала поместить в пятнадцатом номере. Но он не вышел. Четырнадцатый оказался последним нелегальным изданием «Моряка».

Первый легальный номер «Моряка» вышел в четверг 30 марта (12 апреля по новому стилю) 1917 года в Одессе. Еженедельная газета стала органом Всероссийского союза моряков торгового флота. И снова на первой полосе — обращение к читателям: «Товарищи моряки! Газета «Моряк» исключительно обслуживает интересы всех без исключения тружеников моря. Здесь на страницах вашего органа Вы смело можете помещать все ваши сомнения, взгляды и недоразумения». Газета обещала «оглашать слова истины и поддерживать свободу, равенство, братство, способствовать печатным словом единению моряков торгового флота».